2014年1月10日，2013年度国家科学技术奖励大会在人民大会堂隆重举行。本年度的国家科学技术奖共授予10位科技专家和313个项目。
信息科学技术学院有两项成果获奖。其中，由北京大学为第一完成单位、许进（软件研究所）为第一完成人的项目“生物计算中数据编码与模型构建理论方法研究”获国家自然科学二等奖；黄如（微纳电子学研究院）作为主要完成人参与的项目“超大规模集成电路65-40纳米成套产品工艺研发与产业化”获国家科技进步二等奖。
自2002年至今，学院共获国家级科技奖20项（北京大学为第一完成单位的10项），其中自然科学二等奖4项（北京大学为第一完成单位的3项），技术发明二等奖4项（北京大学为第一完成单位的3项），科技进步二等奖12项（北京大学为第一完成单位的4项）。
