师资队伍

A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z

张成

职称:副研究员

研究所:软件研究所

研究领域:

办公电话:86-10-62750359

电子邮件:zhangcheng369@pku.edu.cn

课题组网站:http://dnav2.zzkj.net.cn/

个人主页:




研究领域:

生物计算、核酸分子电路、DNA存储、智能纳米机器人,纳米孔单分子检测及信息处理、超分辨分子探针成像和DNA自组装等方面的研究。

研究成果概况:

以第一或通讯作者在Nano Letters,Nucleic Acids Research,ACS AMINanoscale,Chemical Communications,Analytical Chemistry,Applied Physics Letters,中国科学F,中国科学C,科学通报等期刊上发表论文30余篇。其中JCR一区文章13篇,二区文章6篇(其中8篇IF>8.0)。2012年,教育部自然科学一等奖(排名5)。

作为负责人,主持科技部国家重点研发计划重点专项、国家自然科学基金面上项目3项,教育部装备预研联合基金、北京市自然科学基金面上项目、国防预研基金、博士后特别资助基金。参与国家自然科学基金委重大仪器专项、国家自然科学基金重点项目2项、重大应急项目、重大国际合作项目。申请发明专利5项,获得授权3项。

科研/教育经历:

2007-2010,博士,北京大学

2010-2012,博士后,北京大学

2013-至今,北京大学任教

2014.10-2015.10,美国亚利桑那州立大学,访问学者

2010.09-2011.11,美国普渡大学,访问学者

主要科研项目:

(1)国家重点研发计划重点专项:基于DNA自组装复合纳米孔技术的生物大分子检测(2019年,384万,主持人)。

(2)国家自然科学基金项目:基于荧光传感的DNA计算系统(2018年,80万,主持人)。

(3)教育部装备联合基金:分子自组装纳米3D打印技术的研究(2018年,80万,主持人)

(4)北京市自然科学基金:结合DNA自组装的可变构固态纳米孔(2018年,20万,主持人)

(5)国家自然科学基金项目:模块化自组装DNA计算模型的研究(2018年,20万,主持人)。

(6)国家自然科学基金项目:自组装DNA纳米颗粒计算模型的研究(2013年,80万,主持人)。

(7)国防预研项目:基于DNA计算的纳米系统研究(2013年,20万,主持人)。

(8)国家博士后特别资助项目:自组装DNA纳米颗粒分子高密存储器件(2011年,10万,主持人)。

(9)国家自然科学基金重大应急专项:基于DNA计算的人工智能新方法,(2017年,220万,参与人)。

(10)国家自然基金重大仪器专项:自组装DNA纳米芯片分子信号综合检测系统,(2012年,280万,第1参与人)。

(11)国家自然基金重点项目:基于机器学习的蛋白质相互作用与功能预测方法研究(2013年,280万,子课题负责人)。

(12)国家自然基金重点项目:基于细胞(膜与核酸)的计算模型和算法研究,(2013年,280万,子课题负责人)。


代表性论文:(通讯作者*

1.     Linqiang Pan, Yingxin Hu, Taoli Ding, Zhiyu Wang, Chun Xie, Zhekun Chen, Jing Yang, Zhang Cheng*. Aptamer-based regulation of transcription circuits, Chemical Communications, 2019. (IF: 6.3)

2.     Xuedong Zheng, Jing Yang, Changjun Zhou, Zhang Cheng*, Qiang Zhang, Xiaopeng Wei, Allosteric DNAzyme-based DNA logic circuit: operations and dynamic analysis, Nucleic Acids Research, 2019. (IF: 11.2)

3.     Yang Jing, Wu, Ranfeng, Wang Zhiyu, Pan Linqiang, Zhang Qiang, Lu Zuhong, Zhang Cheng*, Entropy-Driven DNA Logic Circuits Regulated by DNAzyme, Nucleic Acids Research, 2018. (IF: 11.2)

4.     Linqiang Pan, Zhiyu Wang, Fanyi Li, Jing Yang, Qiang Zhang, Cheng Zhang*. Nicking enzyme-controlled toehold regulation for DNA logic circuits, Nanoscale, 2017. (IF: 7.23)

5.     Cheng Zhang*, Jing Yang, Shuoxing Jiang, Yan Liu and Hao Yan, DNAzyme-Based Logic Gate-Mediated DNA Self-Assembly. Nano Letters, 2016.  ( IF: 13.59)

6.     Jing Yang, Shuoxing Jiang, Xiangrong Liu, Linqiang Pan, Cheng Zhang*, Aptamer-Binding Directed DNA Origami Pattern for Logic Gates, ACS Appl. Mater. Interfaces, 2016. (IF: 8.1)

7.     Jing Yang, Zhichao Song, Shi Liu, Qiang Zhang, Cheng Zhang*, Dynamically arranging gold nanoparticles on DNA origami for molecular logic gates, ACS Appl. Mater. Interfaces, 2016, 22451. ( IF: 8.1)

8.     Cheng Zhang*, Linjing Shen, Chao Liang, Yafei Dong, Jing Yang, Jin Xu, DNA sequential logic gate using two-ring DNA, ACS Appl. Mater. Interfaces, 2016, 8, 9370-9376. ( IF: 8.1)

9.     Jing Yang, Chen Dong, Yafei Dong, Linqiang Pan, and Cheng Zhang*. Logic Nanoparticle Beacon Triggered by the Binding-Induced Effect of Multiple Inputs. ACS Appl. Mater. Interfaces, 2014, 6 (16), 14486–14492. ( IF: 8.1)

10.   Cheng Zhang*, Liuqing Wu, Jing Yang, Shi Liu and Jin Xu, A Molecular Logical Switch beacon controlled by thiolated DNA signals, 2013, Chemical Communications, 2013, 49, 11308-11310.   ( IF: 6.3)

11.   Cheng Zhang*, Jingjing Ma, Jing Yang, Shi Liu, and Jin Xu, Binding Assistance Triggering Attachments of Hairpin DNA onto Gold Nanoparticles. Analytical Chemistry, 2013, 85 (24), 11973–11978.  ( IF: 6.1)

12.   Cheng Zhang*, Jingjing Ma, Jing Yang, Nanoparticle aggregation logic computing controlled by DNA branch migration. Applied Physics Letters, 103, 093106, 2013.    ( IF: 3.5)